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FreeSurfer预处理结果文件含义

recon文件夹: 所有的预处理结果存放在recon中,recon含有所有被试的预处理结果,以及一个fsaverage的超链接文件夹,里面的文件是FreeSurfer的标准空间模板 在每个被试的预处理文件中有8个文件夹,主要关注前5个文件夹里面…

人类杏仁核的核团:手动分割到自动图谱

杏仁核由多个核团组成,与边缘系统以及大脑其他部分具有独特的功能和连接。然而,将杏仁核自动分割成多个核团的标准体内神经成像工具仍然很少。本文在7 T 场强 (n 10) 下以高分辨率 (100–150 m) 扫描死后标本,可视化并标记九个杏仁核核团&am…

freesurfer使用

一.做灰白质分割 我的目的是得到某被试的脑白质mask。 1.首先找了freesurfer教程,直接打开了freeview; 2.可视界面中没有直接的wmseg功能; 3.去使用freeview的手册查询wmseg(开始怀疑这种操作不叫该名词..)&#x…

Freesurfer学习笔记——Introduction to Freesurfer Output(输出简介)

先看看通过freesurfer我们得到的输出是什么样子的&#xff0c;做到胸中插竹子。 Preparations&#xff08;准备工作&#xff09;&#xff1a;下载数据集&#xff0c;设置环境 export TUTORIAL_DATA<path_to_your_tutorial_data> //导入环境&#xff0c;设…

Freesurfer学习笔记——Multimodal Integration(3 Diffusion and DTI Integration) 8/13

Diffusion Imaging Basics Diffusion扩散 MR imaging&#xff08;dMRI&#xff09;扩散成像是为了测量水分子在组织中的扩散。在大脑中&#xff0c;白质束像小稻草一样限制扩散的方向。因此&#xff0c;Diffusion tensor imaging&#xff08;DTI&#xff09;扩散张量成像分析是…

【Img_pipe for iElectrodes Localization】

Img_pipe for iElectrodes Localization 本方法基于对ChangLubUcsf实验室的方法的复现&#xff0c;github地址&#xff1a;https://github.com/changlabucsf/img_pipe 1.Alignment of T1 scan to AC-PC Axis Q: 什么是AC-PC&#xff1f; A: AC和PC分别代表前连合&#xff08;…

FreeSurfer入门(1) Output Data

目录 前言一、使用freeview查看卷二、使用freeview查看3D surfacePial surfacewhite surfaceInflated SurfaceThickness MapCortical Parcellation 前言 因一些原因需要学习FreeSurfer,然而教程比较少有些难懂,看了一段时间觉得可能要钻钻牛角尖才可以完成学习,所以开始记笔记…

PCI的imagework已由freeview软件代替

作者&#xff1a;朱金灿 来源&#xff1a;http://blog.csdn.net/clever101 在PCI 9.1中重要模块集成显示环境imagework还存在&#xff0c;但是到了PCI 10.0中imagework已经消失了。以前还有点纳闷&#xff0c;今天发现原来的imagework模块的相当一部分功能已经放到了PCI推出的…

Freeview%20Play是什么

Freeview Play 是一款类似 YouView 的电子节目指南&#xff08;EPG&#xff09;&#xff0c;可让您向前浏览以查看即将到来的一周即将观看的节目&#xff0c;并向后滚动观看您可能错过的节目。简而言之&#xff0c;它是直播电视和点播&#xff0c;都集中在一个地方&#xff0c;…

解决freesurfer:freeview命令在ubuntu20.04.5环境下报错“... no Qt platform platform plugin could be initialized .

问题1&#xff1a; 输入freeview指令后&#xff0c;报错“... no Qt platform platform plugin could be initialized ...” 解决&#xff1a; 使用命令安装pyqt5: sudo apt-get install python3-pyqt5 sudo apt-get install python3-pyqt5.qttools 执行命令过程中提示的非…

关于freesurfer使用freeview可视化的问题:在freeview load图像上去后,出现了异常,如何修复?

🏆本文收录于《全栈Bug调优(实战版)》专栏,主要记录项目实战过程中所遇到的Bug或因后果及提供真实有效的解决方案,希望能够助你一臂之力,帮你早日登顶实现财富自由🚀;同时,欢迎大家关注&&收藏&&订阅!持续更新中,up!up!up!! 全文目录: 🍲问题…

wsl2 解决freeview recon edit 无法正常开启

一、wsl2安装后正常使用freesufer跑recon-all&#xff0c;有天需要使用recon edit校正&#xff0c;但是recon edit 无法修改为擦除模式。 能正常加载数据&#xff0c;也能点击打开recon edit 进行勾画&#xff0c;但是无法改为擦除模式 开启X-server&#xff0c;并修改DISPLAY的…

关于freesurfer使用freeview可视化的问题,Freeview显示的 MRI 图像出现了异常,如何解决?

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FreeSurfer 第三弹(预处理结果以及freeview可视化初步)

FreeSurfer 第三弹(预处理结果以及freeview可视化初步) 跑过recon重建之后,结果就放在以下两个文件夹(demo1、demo2) fsaverage文件是freesurfer用的标准空间 demo1-scripts文件夹下: -recon-all.log日志文件:可以打开看文档最下面的运行结果,检查看程序运行上是否报…

freeview gui 子窗口点不了?如何解决?

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freesurfer指令介绍二:Freeview

Freeview检查图像质量 https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/ https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki FreeviewFreeview 是一种功能类似于 tkmedit、tksurfer 和 scuba 的可视化工具。它与 tkmedit 的不同之处在于它可以一次加载多个体积,可用于可视化高分辨率 (100um)…

Sorry, you have been blocked(Chatgpt登录被屏蔽)

解决办法&#xff1a; 关闭浏览器&#xff0c;重新打开 vpn换个地区&#xff0c;换个美国的vpn

我的世界java版高清修复_[1.7.5]Minecraft我的世界高清材质修复补丁MCPATCHER HD

简介 虽然说现在官方已经支持16x以上的材质了&#xff0c;但是在某些材质使用中还是会出现各种问题&#xff0c;那么我们使用高清材质最好还是先安装下高清材质补丁&#xff0c;以达到更好的游戏体验效果。 工具介绍&#xff1a; MCpatcher HD Fix 是一款基于java制作的软件&am…

14个免费好用的建站工具

01、Wix 地址&#xff1a;https://www.wix.com/ 02、WordPress 地址&#xff1a;https://wordpress.com/zh-cn/ 03、WebsiteBuilder 地址&#xff1a;https://www.imcreator.com/ 04、IM Creator 地址&#xff1a;https://www.imcreator.com/ 05、SiteBuilder 地址&…

2000-2023中国经济政策不确定性指数EPU(China Economic Policy Uncertainty Index)月度数据、日度数据、政策细化指数(包括财政、货币、贸易、外汇和资本账户

2000-2023中国政策不确定性指数EPU 此处仅仅数据搬运&#xff0c;因此链接内免费分享 1、数据来源&#xff1a;https://economicpolicyuncertaintyinchina.weebly.com/ 2、时间跨度&#xff1a;2000-2022 3、区域范围&#xff1a;全国 4、指标说明&#xff1a; 分别有中国经济…