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统计遗传学：第四章，GWAS分析
4. GWAS分析介绍
大家好，我是飞哥。
前几天推荐了这本书，可以领取pdf和配套数据代码。这里，我将各个章节介绍一下，总结也是学习的过程。
引文部分是原书的谷歌翻译，正文部分是我的理解。
第一部分基础，…
locuszoomr！这个 R 包可视化 GWAS 结果数据绝对够顶
生信碱移
locuszoomr可视化GWAS结果
locuszoomr 是由伦敦玛丽王后大学的研究者开发的R包，允许用户生成出版级别的基因组位点注释图，这可以用于可视化并解读 GWAS 分析结果。由 locuszoomr 生成的基因位点注释图通过 R 基础图形或 ggplot2 生成…
GWAS 教程之QC
数据文件下载，输入下行命令直接克隆即可。
git clone https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial.git
就会下载4个Tutorial的文件：
1_QC_GWAS.zip
2_Population_stratification.zip
3_Association_GWAS
4_ PRS.doc
前三个过程必须按顺序跑完&…
笔记 GWAS 操作流程2-1：缺失质控
主要介绍 --geno筛选SNP；--mind筛选样本 GWAS分析时，拿到基因型数据，拿到表型数据，要首先做以下几点：
1，查看自己的表型数据，是否有问题2，查看自己的基因型数据，是否有问…
Hough变换的理解
Hough变换： 原理：将一个空间映射到另一个空间。这里是将X，Y空间映射到R,Φ空间。看下图：左图是X,Y空间的直线，该直线方程：ykx b，确定方程的参数k,b也可以组成一个空间，这个空间中的…
智能图像分析——Hough变换
一、原理
引用 hough变换利用点、线对偶的思想，把提取图像空间中直线的问题转换成在参数空间/hough空间中计算点的峰值的问题。 在x − y坐标系中，假设有一条直线过点( x0 , y0 )，那么我们可以把这条直线的方程记为 ymxb（1&#…
hough森林 matlab,霍夫变换（Hough
原创文章，转载请留言，注明出处 首先简要介绍一下什么是霍夫变换，以及它可以实现什么。霍夫变换最早用于提取图像中的直线，后来经过不断的改进，已经可以用来提取圆，正方形等简单的线条或形状。下面的介绍主要…
Hough Transform
文章目录 代码skimage.transform.hough_line 本来想偷懒不记录的, 但是这个Hough Transform实在是有趣. 通过Canny算法等将edge的大体部分检测了出来, 但是往往这些检测出来的点并不是连续的, 那么怎么才能将这些点合理地连接在一起呢? 这个Hough Transform就可以做到这一点. …
使用Hough变换检测直线
使用Hough变换检测直线
flyfish
函数实现 int detect_line(cv::Mat &src, int threshold, std::vector<cv::Vec2f> &lines)
{cv::Mat dst src.clone();cv::Canny(src, dst, 50, 200, 3);cv::HoughLines(dst, lines, 1, CV_PI / 180, threshold); // 像素, 弧度…
Hough Transform Tutorial
文章目录 霍夫变换方法的目标，图像准备直线表示从图像空间映射到霍夫空间寻找霍夫线霍夫线参数用 Python 实现示例结果霍夫变换
它在许多计算机视觉应用程序中非常有用。霍夫变换的原始形式旨在识别直线。这就是我今天要解释的内容。此外，该技术后来被推广到检测其他形状，如…
MATLABHough变换
智能2112杨阳
一、目的
熟悉在MATLAB中如何使用Hough变换对图像进行检测，计算获得矢量化的边缘特征。
二、平台
MATLAB
三、内容
1、要求
选取一副图像(如房屋图像)，利用hough变换检测，计算获得矢量化的边缘特征。
2、思路 首先先将彩…
Hough变换直线检测
作者：云外阳光 链接：https://www.zhihu.com/question/35268803/answer/82100453 来源：知乎 著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。 先组略的答一下，待整理： yk*xb形式的直线…
Hough变换（含MATLAB实现）
目录
一、Hough变换简介
二、Hough变换的数学理解
1.x-y变量空间至k-b参数空间的变换
2.x-y变量空间至-空间的变换
三、Hough变换应用于线检测（MATLAB实现）
1.检测步骤
2.使用MATLAB工具箱中的Hough变换函数进行边缘检测 一、Hough变换简介
霍夫…
Hough变换直线提取以及尺寸测量
一、Hough变换的定义 霍夫变换是一种从图像空间到参数空间的变换。对于直线检测问题，参数空间是一个二维直角坐标系（ρ, θ），其中ρ表示原点到直线的距离，θ表示该直线与水平轴的夹角。对于圆检测问题，参数…