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利用毒株的accession号，批量下载fasta格式的文件
一、安装好Entrez Driect 见：http://www.cnblogs.com/lmt921108/p/8087474.html 二、在NCBI官网找到需要下载的文件的accession号 二.创建bash脚本文件 1.下载全基因组fasta序列(get_comseq.sh) 1 #!/bin/bash2 3 cat $1 | while read line4 do5 efetch -db nucleot…
【论文写作】EI收录号Accession number中的数字的含义
举例如下：
Accession number:20173504089490
含义：
其中1-4位代表年份，5-6位代表本年度的第几周，7-8位代表类别。
Accession number：20173504089490 2017是2017年，35是第35周，也就是这篇论文…
如何根据SRA accession number 从NCBI下载数据
根据 accession number从NCBI下载FASTQ/FASTA格式的测序数据（pig）
1. 打开NCBI（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/），输入accession number搜索，我查阅一些文献是关于通城猪的（SRX510749 ）（Li X, et al. 2014. Genome-wide scans to detect positive selection in Large…
Refseq : accession id to taxonomy lineage.
本文介绍的是关于Refseq生物基因组数据库库，如何从物种的accesion id 转化到具体的 taxonomy lineage的方法： 下载Refseq的完整基因组数据
我们可以通过ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/complete/ 来下载完整的基因组数据，从htt…
RefSeq Protein Accession转换为蛋白质（YP_009227197转换成Protein）
转换工具：https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php
RefSeq Protein Accession RefSeq Protein Info YP_009227197 YP_009227197 [Seq_length: 168] [Division: VRL] [Organism: Zika virus] [Definition: membrane glycoprotein precursor M [Zika virus].…
【生物信息学学习】第一天：生物数据库使用
【生物信息学学习】第一天：生物数据库使用 生物数据库一、文献搜索（PubMed）1. 什么是PubMed2. PubMed存在的问题 二、一级核酸数据库1. GenBank解读GenBank 2. ENA3. DDBJ4. INSDC5. 基因组数据库Ensemble6. 微生物宏基因组数据库JCVI 三、二…
从EBI中ENA数据库下载原始数据accession的详细信息以及序列
文章目录 1. ENA 数据库的检索功能1. 简单搜索2. 复杂搜索 2. ENA 数据库中的accession的详细信息下载3. ENA 数据库中的accession的序列下载 学生物的大概都会用到EBI数据库，而其中的ENA数据库更是包含着丰度的序列信息，那么怎么获取他们呢？…
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Solid Converter PDF10.1Crack,将pdf表转换为可编辑的Excel文档 Solid Converter PDF是Solid Documents的软件，可将PDF文档转换为Word，Excel，PowerPoint，HTML或纯文本文件，以及从任何可打印程序创建PDF。轻松将您的pdf…
Mac系统Jython安装与使用
参考：https://blog.csdn.net/HUANGQIN19880508/article/details/84523608
1.安装和配置java环境，参考：https://blog.csdn.net/done58/article/details/51138057
2.安装python
3.安装homebrew,通过brew安装
brew install jython
4.python…
jython-installer-2.7.1下载安装
下载地址：https://www.mvnjar.com/org.python/jython-installer/2.7.1/detail.html
官网：https://www.jython.org/download
安装：
1、 2、 3、 4、 5、 6、next 7、 8、 安装过程傻瓜式的，没有什么特别注意点
接下来重点&…
JMeter中利用Jython运行Python代码
导学
1、JMeter编写Python的前置：依赖什么jar包、在哪里写？
2、Jython是什么？有什么特点？以及Jython中的Python有哪些需要注意的？
3、JMeter编写Python需要注意什么？ 介绍
Jython是Python和Java的结合。…
Jython3 项目安装与使用文档
Jython3 项目安装与使用文档 jython3 A sandboxed attempt at v3 (not maintained) 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/jy/jython3
1. 项目目录结构及介绍
Jython3 项目的主要目录结构如下：
jython3/
├── Demo/ # 示例代码目录
├…
jython 简单入门
简单记录一下如何使用jython
jython是什么? 摘自百度百科 Jython是一种完整的语言，而不是一个Java翻译器或仅仅是一个Python编译器，它是一个Python语言在Java中的完全实现。 jython如何使用?
官方给出了几种方式,可以安装,可以用依赖导入,我选取mave…
java jython 调用,JavaDemo——Java通过Jython调用py脚本
maven导入： org.python jython-standalone 2.7.2 准备python文件test2.py： #!/usr/bin/env python3 # codingutf-8 xyzhello python abc1234 class Result: s r 0.0 def __init__(self, s, r): self.s s self.r r def func_cls(x, y): print(py fun…
JavaDemo——Java通过Jython调用py脚本
maven导入：
<!-- https://mvnrepository.com/artifact/org.python/jython-standalone --><dependency><groupId>org.python</groupId><artifactId>jython-standalone</artifactId><version>2.7.2</version></d…
Jython中文乱码问题
在java中调用jython执行python脚本，脚本中的中文出现乱码，脚本如下：
import com.alibaba.fastjson.JSON;
import com.alibaba.fastjson.JSONObject;
import org.python.core.Py;
import org.python.core.PyFunction;
import org.python.core…
如何下载Jython
写在前面：现在大家找Jython的下载方式的时候估计大部分都是之前版本的下载方式，目前，下载页面发生了变化；而我看到大家写的Jython下载都是草草带过，并且都在复制粘贴。本着“人人为我，我为人人”的原则&…
Jython的安装和配置环境
Jython的安装和配置环境
1、下载Jython
2、安装Jython
3、配置环境变量，添加三部分 4、在命令行输入 jython，安装成功 1、下载Jython
官网：Downloads | Jython 2、安装Jython
win r 打开cmd
使用 cd 命令跳转到Jython的下载位置
运行…
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