这是唐海宝老师GitHub上的JCVI工具的非官方说明书。 该工具集的功能非常多，但是教程资料目前看起来并不多，因此为了能让更多人用上那么好用的工具，我就一边探索，一边写教程 fetch模块里封装了好几个数据库的下载方式 bisect: 搜索…

【小白从小学Python、C、Java】 【Python全国计算机等级考试】 【Python数据分析考试必会题】 ● 标题与摘要 Python中通过索引名称提取数据 loc()函数 Python中通过行和列下标提取数据 iloc()函数 ● 选择题 以下说法错误的是： A loc函数通过行和列的名称…

启动子（promoter）是与RNA聚合酶及转录因子结合调节基因表达的序列。 下边我们以人的“FAU”为例介绍一下启动子的查找： 网址：http://genome.ucsc.edu/index.html 1.打开网页，如下图选择左上角下拉菜单的“Human GRC…

1. 下载 NCBI公共数据库下载 或者SRA官网下载，SRA (https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/)网页：直接获取一个项目号里所有样本run号 下载后，sra文件转换为fastq格式 利用fastq-dump软件，服务器上有，现成使用…

在海量的组学数据中，我们经常需要根据已有的差异表达基因找到对应的注释信息。那么针对一系列基因ID批量获取其注释无疑能够大大简化后继的分析，提高科研效率。本次来分享使用python爬虫完成NCBI基因注释的方法。 Sample input： 输入文件如下…

这次爬取的植物分类，也就是 植物所属的界、门、纲、目、科、属、门、种，来自于下面这个网站提供的接口，用户注册之后每天能够调用2000次API。Species 2000 China,Catalogue of Life China,CoL China 物种2000中国节点 中国生物物种名录 (sp20…

在「JCVI教程」使用JCVI进行基因组共线性分析(上)还是有一个尴尬的事情，就是只用到两个物种，不能展示出JCVI画图的方便之处，因此这里参考https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)的分析，只不过画图部分拓…

新手上路，如何快速了解自己课题，含有DNA、RNA序列等信息的核酸数据库肯定是需要了解滴。今天分享一部分大家会比较常用到的，可结合自己的研究背景挑选使用，主要是应用在组学研究or基因功能研究中。 生信小白入门必看网站&#xf…

Natural variation in GmSW17 controls seed size in soybean GmSW17的自然变异控制大豆种子的大小 摘要 种子大小/重量在决定作物产量中起着重要作用，但在大豆中，仅有少数控制种子大小的基因被鉴定出来。在本研究中，我们进行了全基因组关联…

写在前面 今天课题组师妹与我提到，其要下载Phytozome上的所有数据。这个事情，我在早在几年前干过。不过前年有整了一次。整体简单，以下附上之前的记录。 2017年的记录 稍微整理了流程，方便批量下载JGI基因组数据。因为一个一个点，一个一个下载，太浪费时间且不稳定。调试了…

Phytozome 作为专门收录植物基因组的网站，在基因组数据的下载、查询、可视化浏览等方面做的也很不错，也是一个不错的基因组数据下载数据库。 今天主要介绍一下该网站基因组如何下载，如何通过blast查询同源基因，以及根据基因相关功…

1.拟南芥基因组数据的下载 phytozome 是一个收录植物基因组数据的网站，数据整理比较规范，已 经提供了去除可变剪切的 cds 和 protein 序列文件。只有 gff3 文件需要 过滤处理 2. 对拟南芥的注释文件gff3文件进行ID处理，最终得到以下4个文件 …

问题：安装ph1器件包后一直无法正常仿真带IP核的工程，提示各种错误。 在仿真配置时，按照如下操作解决： 结果：

再有 homeBrew 的条件下，在终端上键入此命令： $ brew install httrack可以通过 brew info httrack 获取安装地址 $ brew info httrack在访达中进入名为下载的 httrack 版本的文件夹下名为 bin 的文件夹/usr/local/Cellar/httrack/3.49.2_1/bin 打开名…

HTTrack 是 Kali linux内置的一个工具，主要用于克隆网站。 作用： 1.利用它可以自主控制的环境中查看该网站的完整内容（所有页面和离线文件） 2.HTTrack 进行社会攻击 下载: apt-get install httrack 使用： 1.创建…

实验环境 Metasploitable2-Linux Metasploitable2打开后，可以用web访问 本次使用的是DVMA侦察 Httrack 减少与目标系统交互使用教程 直接输入httrack之后输入项目名称输入项目文件路径输入目标网站访问路径

sudo-su进入权限 终端输入mkdir 创建自己的文件夹 httrack打开软件 enter project 是要爬取的网站 path 即创建的文件夹 *代表爬取所有内容， y代表继续。

下载地址：http://www.pc6.com/softview/SoftView_30936.html 作者：匿名用户 链接：https://www.zhihu.com/question/34188286/answer/108410581 来源：知乎 著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注…

在学习KRPC过程中不断查阅krpc的官方技术文档，加载速度十分捉急，但又苦于没有提供直接的离线文档下载，只能选择尝试整站下载 尝试诸多路径： 1. 在csdn上找到teleport相关资源 teleport下载链接，但创建新项目之后一直…

kali终端输入 apt-get install httrack mkdir mywebsites; cd mywebsites httrack drchaos.com /home/kali/mywebsites/ //此处后面必须加/，否则无法成功执行 https://www.drchaos.com/ //网站地址 最后克隆结果 可以指定在实施时是否使用代理，也可以…