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eqtl-GWAS和GWAS-GWAS

目前教程中有eqtl-GWAS和GWAS-GWAS两种模式,其他模式比较少见,还未进行开发 数据类型cc为分类变量即case/control,quant为连续变量,eqtl数据默认quant coloc.abf有两个比较需要注意的点,就是数据集中N是代表样本量&am…

linux系统 gwas分析,GWAS真的只有关联分析这么简单?

原标题:GWAS真的只有关联分析这么简单? 近年来,全基因组关联分析(Genome wide associationstudy,GWAS)在筛查和鉴定动植物重要经济性状的主效基因方面得到了广泛应用。GWAS关联精度高,研究周期短,已成为功能基因挖掘的重要手段。 我们在看文献的时候一般会看到全基因组关…

根据GWAS数据估算样本量N和使用千人基因组填充maf的参考文献

https://github.com/GenomicSEM/GenomicSEM/wiki/2.1-Calculating-Sum-of-Effective-Sample-Size-and-Preparing-GWAS-Summary-Statistics

linux系统 gwas分析,生信之旅

GWAS的全称是全基因组关联分析(Genome-wide association study),从物种基因组范围内中找出存在的单核苷酸多态性(SNP),与某种表型进行关联分析,从而找出与表型相关的SNPs。进行GWAS分析的软件有很多,今天我们主要使用EMMAX软件&am…

GWAS中最少需要的SNP标记个数计算方法

GWAS和GS分析中,都有一个假定:假定至少有一个SNP标记与所控制性状的QTL(基因)处于连锁不平衡状态(LD),那怎么满足这个条件呢,就需要覆盖全基因组的标记,需要计算群体LD的…

gwas数据根据eaf Z 和N 求beta和se

https://www.nature.com/articles/s41590-023-01588-w#Sec10

小白轻松入门GWAS:从数据准备到可视化结果

在群体重测序的文章中,我们经常看到利用GWAS筛选候选基因。 那么,什么是GWAS?GWAS如何进行分析?需要准备哪些数据?有哪些可视化结果?这些都是新人常常疑惑的问题。本期,我们将与大家探讨全基因…

【生信】全基因组关联分析(GWAS)原理

【生信】全基因组关联分析(GWAS)原理 文章的文字/图片/代码部分/全部来源网络或学术论文,文章会持续修缮更新,仅供大家学习使用。 目录 【生信】全基因组关联分析(GWAS) 1.前提知识介绍 1.1 最小二乘法…

gwas matlab,GWAS群体分层校正,该选用多少个PCA

前言 关于选用多少个PCA做群体分层校正,各大期刊并没有一个统一的说法。 故做了如下综述。 1 随心所欲型,想选多少就选多少 PCA想选多少就选多少,这个真的不是开玩笑。有文献出处有真相! 比如下面文献直接选用10个PCA校正群体分层…

怎么查看SVN当前登陆账号

怎么查看SVN当前登陆账号 前言 今天在接手的项目中,是团队开发,还没有给我账号!那怎么查看呢? 本篇文章仅限Windows用户哦(Q_Q) 查看SVN当前登陆的账号 进这个目录C:\Users\Administrator\AppData\Roam…

Reactor模式详解(转)

在学习netty源码以前,需要熟悉JDK 中的NIO,多线程;了解一些设计模式:例如工厂方法、抽象工厂、建造者、外观、代理等;还有NIO的Reactor和AIO的Proactor模式。下边我转了两篇关于Reactor和Proactor相关内容的文章&#…

reactor实现http服务器

如何在reactor的基础上实现业务?就是怎么利用reactor做服务器,并实现服务器的业务。 本文基于reactor,实现简单的http协议封装。只是为了说明reactor如何做业务,真正的http服务器业务逻辑是很复杂的。 服务器网络这一层&#xf…

Netty高性能架构之Reactor模式

在讨论Netty的架构模式之前,我们先来介绍下Reactor模式,因为Netty的架构模式是在此基础上演变而来的 Reactor模式介绍 1. 线程模型基本介绍 不同的线程模式,对程序的性能有很大影响,为了搞清Netty 线程模式,我们来系…

350行C代码实现epoll reactor模型

有了epoll为什么还需要reactor? 响应快,不必为单个同步事件所阻塞,虽然 Reactor 本身依然是同步的;编程相对简单,可以最大程度的避免复杂的多线程及同步问题,并且避免了多线程/进 程的切换开销&#xff1b…

Reactor响应式编程

Reactor响应式编程 介绍响应式编程 响应式编程(reactive programming)是一种基于数据流(data stream)和变化传递(propagation of change)的声明式(declarative)的编程范式。 如上图…

C#程序加密工具.Net Reactor教程

.NET具有较多的优点,如:标准集成,简化应用,对移动设备的支持等。但使用.NET编写的程序有个致命的缺点:易被反编译,且运行时占用较大的资源。 那么我们就需要用到加密工具 dotNET Reactor 是一款强大的 .NE…

reactor模型实现

文章目录 前言一、什么是reactor模型二、使用步骤1.声明一个reactor结构体2.事件的设置,添加,以及删除2.read,write,accept的事件的处理回调函数3.初始化reactor4.将监听fd加入到reactor5.等待事件6.主函数 三、代码解读总结 前言…

Reactor模式详解

本文翻译至某大神的论文,论文名字叫就叫reactor。 reactor设计模式用于需要并发处理多个客户端的服务器。 1. 举个例子吧 假设我们需要建立一个提供分布式日志服务的事件驱动服务器。客户们使用客户端会向该服务器发送请求记录自己的状态信息,信息包括错…

Reactor 3 参考文档

Reactor 3 参考文档 Stephane Maldini smaldini Simon Basl simonbasle3.2.0.BUILD-SNAPSHOT (译者加)本文档的一些典型的名词如下: Publisher(发布者)、Subscriber(订阅者)、Subscription&…

Reactor模型讲解

一、什么是Reactor模型 反应器设计模式(Reactor pattern)是一种为处理并发服务请求,并将请求提交到一个或 者多个服务处理程序的事件设计模式。当客户端请求抵达后,服务处理程序使用多路分配策略,由一个非阻塞的线程来接收所有的请求&#xf…