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在海量的组学数据中，我们经常需要根据已有的差异表达基因找到对应的注释信息。那么针对一系列基因ID批量获取其注释无疑能够大大简化后继的分析，提高科研效率。本次来分享使用python爬虫完成NCBI基因注释的方法。
Sample input： 输入文件如下…
【Python爬虫】植物分类爬取
这次爬取的植物分类，也就是 植物所属的界、门、纲、目、科、属、门、种，来自于下面这个网站提供的接口，用户注册之后每天能够调用2000次API。Species 2000 China,Catalogue of Life China,CoL China 物种2000中国节点 中国生物物种名录 (sp20…
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「JCVI教程」使用JCVI进行基因组共线性分析(中)
在「JCVI教程」使用JCVI进行基因组共线性分析(上)还是有一个尴尬的事情，就是只用到两个物种，不能展示出JCVI画图的方便之处，因此这里参考https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)的分析，只不过画图部分拓…
生信小白入门必看网站！常用数据库分享
新手上路，如何快速了解自己课题，含有DNA、RNA序列等信息的核酸数据库肯定是需要了解滴。今天分享一部分大家会比较常用到的，可结合自己的研究背景挑选使用，主要是应用在组学研究or基因功能研究中。
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大豆重测序-文献精读53
Natural variation in GmSW17 controls seed size in soybean
GmSW17的自然变异控制大豆种子的大小 摘要
种子大小/重量在决定作物产量中起着重要作用，但在大豆中，仅有少数控制种子大小的基因被鉴定出来。在本研究中，我们进行了全基因组关联…
linux 基因组数据下载,批量下载JGI（phytozome植物基因组数据库）数据
写在前面 今天课题组师妹与我提到，其要下载Phytozome上的所有数据。这个事情，我在早在几年前干过。不过前年有整了一次。整体简单，以下附上之前的记录。 2017年的记录 稍微整理了流程，方便批量下载JGI基因组数据。因为一个一个点，一个一个下载，太浪费时间且不稳定。调试了…
linux 基因组数据下载,phytozome植物基因组下载网站
Phytozome 作为专门收录植物基因组的网站，在基因组数据的下载、查询、可视化浏览等方面做的也很不错，也是一个不错的基因组数据下载数据库。 今天主要介绍一下该网站基因组如何下载，如何通过blast查询同源基因，以及根据基因相关功…
拟南芥中基因家族序列的提取
1.拟南芥基因组数据的下载
phytozome 是一个收录植物基因组数据的网站，数据整理比较规范，已 经提供了去除可变剪切的 cds 和 protein 序列文件。只有 gff3 文件需要 过滤处理 2. 对拟南芥的注释文件gff3文件进行ID处理，最终得到以下4个文件 …
modelsim联合安陆FPGA软件TD5.6.5仿真问题记录
问题：安装ph1器件包后一直无法正常仿真带IP核的工程，提示各种错误。
在仿真配置时，按照如下操作解决： 结果：
如何在 Mac 上使用 Httrack 克隆网站
再有 homeBrew 的条件下，在终端上键入此命令：
$ brew install httrack可以通过 brew info httrack 获取安装地址
$ brew info httrack在访达中进入名为下载的 httrack 版本的文件夹下名为 bin 的文件夹/usr/local/Cellar/httrack/3.49.2_1/bin
打开名…
kail Linux httrack简单使用教程
HTTrack 是 Kali linux内置的一个工具，主要用于克隆网站。
作用：
1.利用它可以自主控制的环境中查看该网站的完整内容（所有页面和离线文件）
2.HTTrack 进行社会攻击
下载:
apt-get install httrack
使用：
1.创建…
Web渗透_扫描工具Httrack
实验环境
Metasploitable2-Linux
Metasploitable2打开后，可以用web访问 本次使用的是DVMA侦察
Httrack 减少与目标系统交互使用教程 直接输入httrack之后输入项目名称输入项目文件路径输入目标网站访问路径
kali httrack-网站克隆工具
sudo-su进入权限
终端输入mkdir 创建自己的文件夹 httrack打开软件 enter project 是要爬取的网站
path 即创建的文件夹
*代表爬取所有内容，
y代表继续。
扒网站工具 HTTrack Website Copier
下载地址：http://www.pc6.com/softview/SoftView_30936.html 作者：匿名用户 链接：https://www.zhihu.com/question/34188286/answer/108410581 来源：知乎 著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注…
使用HTTrack Website Copier整站下载
在学习KRPC过程中不断查阅krpc的官方技术文档，加载速度十分捉急，但又苦于没有提供直接的离线文档下载，只能选择尝试整站下载
尝试诸多路径：
1. 在csdn上找到teleport相关资源 teleport下载链接，但创建新项目之后一直…
HTTrack克隆网站工具安装教程
kali终端输入 apt-get install httrack mkdir mywebsites; cd mywebsites httrack drchaos.com /home/kali/mywebsites/ //此处后面必须加/，否则无法成功执行 https://www.drchaos.com/ //网站地址 最后克隆结果 可以指定在实施时是否使用代理，也可以…
HTTrack 网站备份工具
HTTrack可以克隆指定网站－把整个网站下载到本地。可以用在离线浏览上，免费的噢！ 强大的Httrack类似于搜索引擎的爬虫，也可以用来收集信息。记得之前写过篇http://www.cnblogs.com/dcb3688/p/4607985.html Python 爬取网站资源文…
Web工具HTTrack
Web安全工具HTTrack HTTrack介绍 以递归的方式真实爬取网站，减少了与系统之间的交互，便于多次进行网站的分析。只需在浏览器中打开“镜像”网站的页面，即可从链接到链接浏览网站，就像在线查看网站一样。安装方法apt-get install httrack使用方法 首先在本地创建一个文件夹 …
kali安装HTTrack报错Unable to locate package httrack
kali安装后，直接安装Httrack导致报错 Unable to locate package httrack
（这里因为解决了，无法重现，则使用错误的包httrackttttt） 原因：安装kali后第一次使用系统，则应该运行update命令 sudo …
HTTrack Website Copier：离线浏览的利器
HTTrack Website Copier：离线浏览的利器
项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ht/httrack
项目介绍
HTTrack Website Copier 是一款强大的离线浏览器工具，能够将整个网站从互联网下载到本地计算机。通过 HTTrack，用户可以递归地构建所…