一、前言 脑脊液（csf）一直被认为与新陈代谢有重要关联，其为许多神经科学研究提供重要价值，从fMRI图像中提取脑脊液信号可用于多种神经系统疾病的诊断。特别是自2019年Science上那篇著名的csf-BOLD文章发表后，大家都试图…

数据很乱不会重新整理 开始输入文件夹 开始 IMA：西门子的机器 dcm：有些也以dcm结尾 none: 没有后缀，要保证文件里没有任何别的带标志的，不然出错 输入文件夹 output：整理之后的结果 整理成两个格式

dpabi在 电脑里面装了好久了，要捡起来处理fMRI ，小白记录一下首次运行的过程和坑。 1、 基于matlab 安装好DPABI 工具箱 Dpabi的下载与安装 2、自官网下载数据 http://rfmri.org/content/demonstrational-data-resting-state-fmri 3、查看DemoData文件夹…

目标 在Ubuntu服务器的docker镜像中用MATLAB运行DPABI（以及使用DPARSF的功能）。 环境 系统： 在Ubuntu的docker镜像中（Ubuntu 18.04.6 LTS），远程可视化用的是VNC（xfce4）。 MATLAB版…

Tips：对fMRI功能图像和结构图像预处理的可参考另外一篇博主的文章，很详细。点击跳转 但是对于我所要分析研究的fMRI数据没有结构像，所以那篇文章对于我来说也是一个学习和参考，也是摸索了好久才有点头绪，希望自己的一点经验能帮到大家。 目录 一、准备工作二、勾选预处理项…

dpabi下载及安装 dpabi下载后，存储在任意位置，并将存储路径添加到matlab的path，例我的dpabi存储在"E:\matlab\soft\DPABI_V4.0_190305"，添加步骤如下： 运行dpabi 命令行输入dpabi，然后回车 一路确定 选择dpasf

最近打算做一些脑功能相关的分析，采用dpabi这个软件，记录一下遇到的错误 首先是安装，就采用先安装spm12，在安装dpabi 记得关闭VPN，不然一直无法弹出界面，会一直卡在这里

安装过程很简单，官网写的也很明白，会写这篇是因为不太熟悉很多软件，导致安装过程出现了很多小问题。 以前都是在matlab中运行dpabi，matlab安装起来很麻烦，而且安装包很大，我现在用的版本已经有20g，在换电脑的时候重新安装一遍matlab都要小半天。对于不太常用matlab的家…

整个静息态fMRI 影像处理，一个dpabi界面上参数好多呀，先初步理一遍，后面具体处理了再补充记录

1.预处理 这里预处理用Gretna软件进行，共分为以下几步： （1）DICOM转NIfTI格式 (2)去除前10个时间点(Remove first 10 times points)：由于机器刚启动、被试刚躺进去也还需适应环境，导致刚开始扫描的数据很…

DPABI是是中科院心理研究所严超赣老师团队开发的一款磁共振脑影像数据分析工具包。基于SPM，在安装DPABI之前需要安装好SPM，才能正常使用。SPM的安装方法见文matlab2021a版本条件下安装spm_kidllll的博客-CSDN博客 1、下载安装包 下载地址：D…

分析rs-fMRI数据之前进行预处理是第一步，直接上验证过的非常详细的DPABI预处理步骤如下。 1.理论知识——通用的fMRI数据预处理 (1) 去除开始的几个时间点 　　扫描仪启动后，需要初始化，初始化时的磁场是不稳定的，为了去除不稳定…

DPABI小鼠数据处理指南 【下载地址】DPABI小鼠数据处理指南 本仓库提供了一个名为“dpabi小鼠数据处理.pdf”的资源文件，该文件详细介绍了如何使用DPABI工具进行小鼠数据处理。DPABI（Data Processing & Analysis for Brain Imaging）是一款…

最近写文章用到了dpabi里的viewer，记录一下自己用到的功能。 之前用过REST里的viewer，但是个人感觉不太好用，首先REST对matlab的版本有要求，不能太高，matlab2012才可以，matlab2015都不行。再一个，REST需要自己选择under lay的结构图，dpabi的是已经指定了ch2.nii了，比较…

前言 最近在学习使用DPABI对fMRI数据进行分析处理，在处理过程当中难免会遇到一些小问题，而且处理步骤繁多，因此对DPARSF（主要针对体空间分析）的整个处理流程整理成笔记，中间会加上一些自己在处理过程当中遇…

打开MATLAB，输入dpabi，进入dpabi界面，找到quality control并点击 这是直接打开qc的初始界面 1、working directory ： 文件所在路径，即包含FunImg、T1Img、头动信息、normalize信息等的文件夹 2、directory name to ge…

今天基于Matlab 安装了DPABI 工具箱，记录一下过程如下： （1）DPABI下载官网： http://rfmri.org/DPABI （2）dpabi的安装 1）将dpabi 文件夹拷贝到matlab 的安装目录toolbox中 2&#xff…

新手发布，如果有错误或者补充，欢迎捉虫~ 目录 dpabi view的使用及多重比较矫正基本介绍：导入图像：多重比较矫正（基于Cluster）脑区显示结果汇报结果提值 dpabi view的使用及多重比较矫正 打开dpabi&#xf…

最近在学习使用DPABI对fMRI数据进行分析处理，在处理过程当中难免会遇到一些小问题，而且处理步骤繁多，因此对DPARSF（主要针对体空间分析）的整个处理流程整理成笔记，中间会加上一些自己在处理过程当中遇到的问…

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