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完整转录组RNAseq分析流程（tophat2+cufflink+cuffdiff）
前一段时间跟着孟浩巍大神的视频学习，在自己的小破笔记本上还是跑完了整个RNAseq差异表达的分析流程（ tophat2 + cufflink + cuffdiff ）虽然这个流程比较老了，现在做分析一般使用的都是 HTseq + DESeq2 等其他的流程，但是作为入门的知识还是比较容易理解，这篇文章先更一下…
Tophat运行错误
2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准>>> 这两天参照一篇文献，从 NCBI SRA 下载了若干 .sra 文件来处理，发现数据是 single-end 的，相对较老（2012 年），read length 为 35 bp，短一…
TopHat 项目安装与使用教程
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1. 项目目录结构及介绍
TopHat 项目的目录结构如下：
tophat/
├── github/
│ └── w…
OpenCV-顶帽运算（TOPHAT）
作者：翟天保Steven 版权声明：著作权归作者所有，商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处
原理 形态学是图像处理中常见的名词，图像处理的形态学基本属于数学形态学的范畴，是一门建立在格论和拓扑…
halcon 算子 gray_tophat
作用：使用结构元素对图像进行顶帽变换；
顶帽变换定义：一副图像和它的开运算结果的差，称为顶帽变换；
与顶帽对应的是底帽变换；
底帽变换定义：一副图像的闭运算和这幅图像的差，称为…
tophat2安装和问题解决
在安装tophat2安装简单但会碰到小问题，
tophat2安装 wget http://ccb.jhu.edu/software/tophat/downloads/tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz解压 tar -zxvf tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz加入PATH export PATH/home/ZQK/tophat-2.1.0.Linux_x86_64/:$PATH测试…
基于Matlab图像处理之TopHat形态学小目标识别
欢迎大家点赞、收藏、关注、评论啦 ，由于篇幅有限，只展示了部分核心代码。 文章目录 一项目简介 二、功能三、系统四. 总结 一项目简介 一、项目背景与意义
在图像处理和目标识别领域，小目标的检测与识别一直是一个具有挑战性的任务。由于小…
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matlab实现tophat,[问题] 多尺度tophat的实现问题
多尺度tophat的实现问题 各位好，最近在用tophat作图像增强，看了下原理，还蛮简单的，但是在实现多尺度tophat上面遇到些问题，还望高手指点一下。 单尺度tophat和多尺度tophat我都做了，但是可能因为我的实现上…
与黑帽操作(BlackHat))
图像形态学操作之顶帽操作(TopHat)与黑帽操作(BlackHat)
大家看这篇博文前可以先看一看下面这两篇博文，下面这两篇博文是这篇博文的基础： 1、详解图像形态学操作之图形的腐蚀和膨胀的概念和运算过程,并利用OpenCV的函数erode()和函数dilate()对图像进行腐蚀和膨胀操作
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c++视觉处理----顶帽与黑帽
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顶帽与黑帽区别
黑帽（Black Hat）和顶帽（Top Hat）是形态学图像处理中的两种操作，它们用于突出图像中不同类型的细节，具有以下主要区别： 突出的特征类型： 顶…
itk中的黑白TopHat算法
本文要写的是TopHat算法，这个算法属于形态学变换，主要应用在解决当光照不均等条件引起的背景灰度不均问题（敲黑板，TopHat是应用在灰度图像的，不是二值图像！）。TopHat算法本质是形态学变换中开闭…
顶帽变换（Top_hat）算法（学习笔记）
1.绪论
红外图像中的弱小目标的目标属性包涵“弱"和“小’’两个方面：“弱’’是指目标在红外波长上所表现出来的强度，具体反映到所拍摄的红外图像上，就是指目标的灰度值；而“小’’是指目标的尺寸大小，也就是前…
TopHat：优雅的GNOME系统资源监控工具
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TopHat是一款专为GNOME桌面环境设计的系统资源监控工具，旨在为…
ESP8266模块GPIO16使用方式
本次开发ESP８２６６的环境是AiThinker_IDE，在设计一块电路板的时候，因为ESP8266模块原理图直接给出GPIO16，于是在程序没有去验证的情况下直接当做普通GPIO使用。 当实际情况使用时，发现…
全志平台A40I GPIO操作：adb通过debugfs控制GPIO
目录 简述：
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在本篇博客中，将详细介绍如何在全志平台A40I上操作GPIO，特别是如何设置GPIO为输入并获取其值。将通过debugfs进行操作，包括挂载路径、查看节点、指定引脚以及修…
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STM32F1xx官方资料： 《STM32中文参考手册V10》-第8章通用和复用功能IO(GPIO和AFIO ) 芯片数据手册（datasheet) STM32的GPIO介绍
STM32引脚说明
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rk3568 | 瑞芯微平台GPIO引脚驱动编写
最近在玩瑞芯微平台的产品，移植了几个设备的驱动，遇到了一些问题，总结后发现大部分问题都出在了GPIO配置的问题上，写下本篇文章，用来分享一下调试的心得。
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Linux系统应用层GPIO控制
文章目录 Linux一.前言二.GPIO接口创建1.export和unexport2.引脚号 三.GPIO口方向四.GPIO电平五.代码中应用 Linux
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从单片机过度到有操作系统的板子，我们都是从控制GPIO口点灯开始，今天就说一下linux系统下如何控制GPIO
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GPIO输入输出模式原理(八种工作方式附电路图详解)
这几篇博文讲的不错，可参照着理解： STM32下拉输入模式与振动传感器的使用 “上拉电阻与下拉电阻”通俗解读 上、下拉电阻（定义、强弱上拉、常见作用、吸电流、拉电流、灌电流） 个人总结：
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ZYNQ7000-AXI GPIO详解
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