基础知识 1、什么是IP ADDRESS：internet protocol ADDRESS #网络进程地址 ipv4：internet protocol version 4 ip由32位的0或1组成 11111111.11111111.11111111.00000000255.255.255.0 前三位为网络位第四位为主机位 基本命令 ping -c 1 172.25.25…

Python 在解决数据科学任务和挑战方面继续处于领先地位。 目录 核心库 IPython NumPy SciPy Pandas StatsModels 可视化 Matplotlib Seaborn Plotly Bokeh Pydot 机器学习 Scikit-learn XGBoost / LightGBM / CatBoost Eli5 深度学习 TensorFlow P…

写的非常通俗易懂，good 什么是分子描述符？ 所谓分子描述符，是指分子在某一方面性质的度量，既可以是分子的物理化学性质，也可以是根据分子结构通过各种算法推导出来的数值指标 一般选择合适分子描述符的要求 &#…

CADD课程学习（7）-- 模拟靶点和小分子相互作用（AutoDock） 概念： 分子对接是通过研究配体小分子和受体生物大分子的相互作用，预测其亲和力，实现基于结构的药物设计的一种重要方法。 理论基础： 分子对接的最初思想起源于Fisher E提出的“锁和钥匙模型”，即受体与配体相…

2025 年 2 月 14 日是Delphi 的 30 周年纪念日。现在国内的年轻人应该没多少知道 Delphi 这款开发工具。Delphi 是美国 Borland（宝兰）公司于 1995 年开发在 Windows 平台下的快速应用程序开发工具 (Rapid Application Development，简称 RAD)&…

生命的编码 1、前言2、生命结构2.1 生命系统的结构层次2.2 九大系统2.3 人体器官2.4 组织2.5 细胞细胞的基本构成细胞壁细胞膜细胞质细胞器细胞核细胞的活动进程细胞的繁殖方式细胞的化学成分 2.6 DNA主要类别基因组结构遗传密码DNA复制DNA与蛋白质的相互作用转录和翻译信使RNA…

Discovery Studio™ (简称DS)是专业的生命科学分子模拟软件，DS目前的主要功能包括：蛋白质的表征（包括蛋白-蛋白相互作用）、同源建模、分子力学计算和分子动力学模拟、基于结构药物设计工具（包括配体-蛋白质相互作用、全新药物设计和分子对接）、基于小分子的药物设计工具（…

文 / 利刃君 微信ID / ziyuanliren666 全文共1104字，推荐阅读时间6分钟。 教程内容： 以SYBYL-X 2.0软件为例，对小分子配体进行基于Tripos力场的能量最小化计算，优化分子结构，获得合理构象。 1 视频教程 建议在wifi环境下观看~ 2 图文教程 1.导入结构 点击File > Impor…

教程内容： 以SYBYL-X 2.0软件为例，进行分子对接(Surflex-Dock)后创建对接空腔的对接表面教程。 1 视频教程 建议在wifi环境下观看~ 2 图文教程 1.打开对接结果 本期教程以上期教程中生成的对接结果为例进行对接区域的表面添加。 点击Application > Docking Suite > Ana…

文 / 利刃君 微信ID / ziyuanliren666 全文共3067字，推荐阅读时间15分钟。 教程内容： 以SYBYL-X 2.0软件为例，对大分子蛋白受体利用BIOPOLYMER模块进行准备。 1 视频教程 建议在wifi环境下观看~ 2 图文教程 1.导入蛋白 本教程中所用蛋白晶体结构由PDB数据库(http://www.rcs…

CADD课程学习（11）-- 构建已有小分子的构效关系模型(SYBYL) 定量构效关系（QSAR，Quantitative Structure-Activity Relationship）分析是指利用理论计算和统计分析工具来研究系列化合物结构（包括二维分子结构、三维分子结构和电子结构）与其生物效应（如药物的活性、毒性、…

一、PubChem上下载分子 PubChem网址： PubChem (nih.gov) 首页搜索分子AID号，下载sdf格式 ： 二、 SYBYL去除分子中的离子化合物及混合物： 打开sybyl2.0，选择Applications->Ligand Preparation->Set up 去除离子…

问题：正常来说docking后会弹出Results Browse，但我重复多次实验都没弹出，有的同学却可以，原因未知(不排除遗漏细节、操作系统版本......的问题)。 解决方法(共2步) 前提：确保docking运行成功，即右下窗口的…

Sybyl分子对接操作流程 20160817 win7 1、打开sybyl-x 2.0； 2、点击“applications”----“Docking Suite”----“Dock Ligand”； 3、“Docking Mode”：Surflex-Dock（SFXC）； (1)“Filename”栏点击“D…

用Sybyl对3个天然产物库处理 •包括简单的去重复分子和3D构象生成（没有对Bad group进行去除） •1、 Chemdiv 得到8124个分子，重复分子2510个分子 •2、 Zinc得到96991个分子，重复分子70513个分子 •3、 J&K得到84712个分子…

SYBYL-X 2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明 【下载地址】SYBYL-X2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明分享 SYBYL-X 2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明 项目地址: https://gitcode.com/Open-source-documentation-tutorial/cb7cf 资源文件描述 本…

SYBYL-X 2.0：开启3D-QSAR模型构建的新纪元 【下载地址】SYBYL-X2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明分享 SYBYL-X 2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明 项目地址: https://gitcode.com/Open-source-documentation-tutorial/cb7cf 项目介绍 SYBY…

目录 一、环境准备二、Spark 读取MySQL数据的五种方式三、Spark 读取 json 数据四、Spark-sql 中常见函数（1）去重函数：distinct / dropDuplicates（2）过滤函数：filter / except / intersect（3&am…

需要把文件中的cities改成districts [{"name": "中国","subName": "CN","provinces": [{"name": "北京市","code": "110000","districts": [{"name": "东…

在日常办公中，打印机是不可或缺的重要设备。然而，2024年有时在连接共享打印机的过程中，我们可能会遇到错误代码0x0000011b和0x00000709的提示。有更新补丁导致的、有访问共享打印机服务异常、有访问共享打印机驱动异常等问题导致的&#xff0…