Synonyms 入门介绍 Chinese Synonyms for Natural Language Processing and Understanding. 最好的中文近义词工具包。 synonyms可以用于自然语言理解的很多任务：文本对齐，推荐算法，相似度计算，语义偏移，关键字提取&a…

基于solr 6.5.0 版本 1. Solr配置同义词报异常 报错信息 xxx: org.apache.solr.common.SolrException:org.apache.solr.common.SolrException: Could not load conf for core xxx: Cant load schema /www/solrhome/xxx/conf /managed-schema: java.nio.charset.MalformedInp…

欢迎关注"生信修炼手册"！ 衡量一个变异位点的影响时，通常都是给定一个变异类型，比如synonymous SNV 等，来表明其影响。CADD独创了一种打分算法，来衡量变异位点的有害程度。 对于一组变异位点，CAD…

全基因组重测序数据分析 转自：http://www.biodiscover.com/news/research/95875.html 1. 简介(Introduction) 通过高通量测序识别发现de novo的somatic和germ line 突变，结构变异-SNV，包括重排突变（deletioin, duplication 以及…

一、提出任务 单词计数是学习分布式计算的入门程序，有很多种实现方式，例如MapReduce；使用Spark提供的RDD算子可以更加轻松地实现单词计数。 在IntelliJ IDEA中新建Maven管理的Spark项目，并在该项目中使用Scala语言编写Spark的WordCount程序，最后将项目打包提交到Spark集群…

第六章 变异的功能预测 6.1 问题概述 Where did your genetic variations come from? inherited from parentsde novo mutations（70~100个新发突变）somatic mutations（体细胞突变，如癌症） 有很多的先天的小儿疾病…

ver 0.3 更多精彩内容，请关注公众号 前言 我们在前序的文章中，介绍了页表的基本概念，也介绍了多级页表架构。基于前文的中介绍的内容，我们应该搞清楚了如下几个事实： (1) 从地址空间的角度出发，可以将页表…

用到的工具jieba jieba分词，最好用的开源中文分词工具。他最主要的两个功能是分词和关键词的抽取。在这里我们需要用他的分词功能来提取文本中的人名。 gephi gephi是一个开源的复杂网络数据可视化软件，可用于探索数据分析、链路分析、社交网络分析、…

本周最新文献速递20211107 一、精细解读文献 一 文献题目： The context-specific role of germline pathogenicity in tumorigenesis 不想看英文题目： 生殖系致病性突变在肿瘤发生中的特定作用 杂志和影响因子： Nat Genet (IF: 38.33; Q1)…

转换和颠换如发生在基因的蛋白编码区内，根据点突变对和蛋白质翻译产生的影响定性，可以把点突变分为同义突变和非同义突变二种。 1. 基本概念 1.1 同义突变(synonymous mutation) 碱基替换不引起氨基酸改变称为同义突变。 1.2 非同义突变(non-synonym…

这是一篇关于《In silico saturation mutagenesis of cancer genes》论文的解读，肯定有不全的地方，仅仅作为参考，如想深入学习，请结合原文。 In silico saturation mutagenesis 是一种术语，表示用计算方法来评估基因或…

经过半个月的乱七八糟，更新最近能理解的东西 首先自行去官网Introduction - SnpEff & SnpSift (pcingola.github.io)下载一个压缩包，经常用得到，反正数据有问题卸载之后再次安装可以重新构建 这里我重新构建一下，也算是重新…

遗传密码在上世纪六十年代被破解后，人们认识到在蛋白质编码区有四分之一至三分之一的DNA点突变是不会改变蛋白质序列的。这些点突变被称为同义突变，而改变蛋白质序列的点突变则被称为非同义突变。因为同义突变不改变蛋白质序列，所以大家普遍认…

在使用CMAKE编译是找不到CUDA，可以添加参数解决，错误如下 The CUDA compiler identification is unknown CMake Error at /home/XXX_USER/anaconda3/lib/python3.10/site-packages/cmake/data/share/cmake-3.27/Modules/CMakeDetermineCUDACompiler.cm…

指定编译器位置： -DCMAKE_C_COMPILER/usr/bin/gcc -DCMAKE_CXX_COMPILER/usr/bin/g cd ~/software/googletest-master mkdir build cd build cmake ../googletest/ -DCMAKE_C_COMPILER/usr/bin/gcc -DCMAKE_CXX_COMPILER/usr/bin/g make 解决后：

探索Steam游戏评论的深层语义 —— 解析Contextual Topic Identification项目 contextual_topic_identificationSteam review texting embedding analysis项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/co/contextual_topic_identification 在当今这个数字化时代，玩家…

文章目录 1. 背景介绍2. 排查和解决方案 1. 背景介绍 Github提交或者拉取代码时，报错如下： Kex_exchange_identification: Connection closed by remote host fatal: Could not read from remote repository.Please make sure you have the correct ac…

项目场景： a电脑ssh连接局域网内另一台ubuntu20.04电脑b。 a电脑系统：ubuntu20.04 b电脑系统：ubuntu20.04 问题描述 远程连接命令：ssh m192.168.0.108 a电脑终端报错如下： WARNING: REMOTE HOST IDENTIFICATI…

拉取代码时报错： # Mac 报错WARNING: REMOTE HOST IDENTIFICATION HAS CHANGED! IT IS POSSIBLE THAT SOMEONE IS DOING SOMETHING NASTY! Someone could be eavesdropping on you right now (man-in-the-middle attack)! It is also possible that a host key …

论文名称：《MobileNet Based Apple Leaf Diseases Identification》 论文作者： Chao X , Sun G , Zhao H , et al. 发表期刊：Mobile Networks and Applications, 2020(10). 论文总结： Research Gap: 基于MobileNet的苹果叶病害识…