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Freesurfer学习笔记——Correcting Pial Surfaces 3.1
pial surface 的形成：white surface 扩张后会紧贴brainmask.mgz中灰质和脑脊液的强度梯度
Editing the Volume
freeview -v pial_edits_before/mri/T1.mgz \
pial_edits_before/mri/brainmask.mgz \
-f pial_edits_before/surf/lh.white:edgecoloryellow \
pial_e…
FreeSurfer预处理结果文件含义
recon文件夹：
所有的预处理结果存放在recon中，recon含有所有被试的预处理结果，以及一个fsaverage的超链接文件夹，里面的文件是FreeSurfer的标准空间模板 在每个被试的预处理文件中有8个文件夹，主要关注前5个文件夹里面…
人类杏仁核的核团：手动分割到自动图谱
杏仁核由多个核团组成，与边缘系统以及大脑其他部分具有独特的功能和连接。然而，将杏仁核自动分割成多个核团的标准体内神经成像工具仍然很少。本文在7 T 场强 (n 10) 下以高分辨率 (100–150 m) 扫描死后标本，可视化并标记九个杏仁核核团&am…
freesurfer使用
一.做灰白质分割
我的目的是得到某被试的脑白质mask。
1.首先找了freesurfer教程，直接打开了freeview；
2.可视界面中没有直接的wmseg功能；
3.去使用freeview的手册查询wmseg（开始怀疑这种操作不叫该名词..）&#x…
Freesurfer学习笔记——Introduction to Freesurfer Output（输出简介）
先看看通过freesurfer我们得到的输出是什么样子的，做到胸中插竹子。
Preparations（准备工作）：下载数据集，设置环境
export TUTORIAL_DATA<path_to_your_tutorial_data> //导入环境，设…
 8/13)
Freesurfer学习笔记——Multimodal Integration(3 Diffusion and DTI Integration) 8/13
Diffusion Imaging Basics
Diffusion扩散 MR imaging（dMRI）扩散成像是为了测量水分子在组织中的扩散。在大脑中，白质束像小稻草一样限制扩散的方向。因此，Diffusion tensor imaging（DTI）扩散张量成像分析是…
【Img_pipe for iElectrodes Localization】
Img_pipe for iElectrodes Localization
本方法基于对ChangLubUcsf实验室的方法的复现，github地址：https://github.com/changlabucsf/img_pipe
1.Alignment of T1 scan to AC-PC Axis Q: 什么是AC-PC？ A: AC和PC分别代表前连合（…
 Output Data)
FreeSurfer入门(1) Output Data
目录 前言一、使用freeview查看卷二、使用freeview查看3D surfacePial surfacewhite surfaceInflated SurfaceThickness MapCortical Parcellation 前言
因一些原因需要学习FreeSurfer,然而教程比较少有些难懂,看了一段时间觉得可能要钻钻牛角尖才可以完成学习,所以开始记笔记…
PCI的imagework已由freeview软件代替
作者：朱金灿
来源：http://blog.csdn.net/clever101 在PCI 9.1中重要模块集成显示环境imagework还存在，但是到了PCI 10.0中imagework已经消失了。以前还有点纳闷，今天发现原来的imagework模块的相当一部分功能已经放到了PCI推出的…
Freeview%20Play是什么
Freeview Play 是一款类似 YouView 的电子节目指南（EPG），可让您向前浏览以查看即将到来的一周即将观看的节目，并向后滚动观看您可能错过的节目。简而言之，它是直播电视和点播，都集中在一个地方，…
解决freesurfer：freeview命令在ubuntu20.04.5环境下报错“... no Qt platform platform plugin could be initialized .
问题1：
输入freeview指令后，报错“... no Qt platform platform plugin could be initialized ...”
解决：
使用命令安装pyqt5:
sudo apt-get install python3-pyqt5
sudo apt-get install python3-pyqt5.qttools
执行命令过程中提示的非…
关于freesurfer使用freeview可视化的问题：在freeview load图像上去后，出现了异常，如何修复？
🏆本文收录于《全栈Bug调优(实战版)》专栏，主要记录项目实战过程中所遇到的Bug或因后果及提供真实有效的解决方案，希望能够助你一臂之力，帮你早日登顶实现财富自由🚀；同时，欢迎大家关注&&收藏&&订阅！持续更新中，up！up！up！！ 全文目录： 🍲问题…
wsl2 解决freeview recon edit 无法正常开启
一、wsl2安装后正常使用freesufer跑recon-all，有天需要使用recon edit校正，但是recon edit 无法修改为擦除模式。 能正常加载数据，也能点击打开recon edit 进行勾画，但是无法改为擦除模式 开启X-server，并修改DISPLAY的…
关于freesurfer使用freeview可视化的问题，Freeview显示的 MRI 图像出现了异常，如何解决？
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FreeSurfer 第三弹（预处理结果以及freeview可视化初步）
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跑过recon重建之后，结果就放在以下两个文件夹（demo1、demo2） fsaverage文件是freesurfer用的标准空间
demo1-scripts文件夹下： -recon-all.log日志文件：可以打开看文档最下面的运行结果，检查看程序运行上是否报…
freeview gui 子窗口点不了？如何解决？
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freesurfer指令介绍二：Freeview
Freeview检查图像质量 https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/ https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki
FreeviewFreeview 是一种功能类似于 tkmedit、tksurfer 和 scuba 的可视化工具。它与 tkmedit 的不同之处在于它可以一次加载多个体积，可用于可视化高分辨率 （100um）…
Sorry, you have been blocked（Chatgpt登录被屏蔽）
解决办法：
关闭浏览器，重新打开
vpn换个地区，换个美国的vpn
![我的世界java版高清修复_[1.7.5]Minecraft我的世界高清材质修复补丁MCPATCHER HD](http://pic.002.xiahunao.cn/pnds/我的世界java版高清修复_[1.7.5]Minecraft我的世界高清材质修复补丁MCPATCHER HD)
我的世界java版高清修复_[1.7.5]Minecraft我的世界高清材质修复补丁MCPATCHER HD
简介 虽然说现在官方已经支持16x以上的材质了，但是在某些材质使用中还是会出现各种问题，那么我们使用高清材质最好还是先安装下高清材质补丁，以达到更好的游戏体验效果。 工具介绍： MCpatcher HD Fix 是一款基于java制作的软件&am…
14个免费好用的建站工具
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