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光荚含羞草基因组-文献精读26
Haplotype-resolved genome of Mimosa bimucronata revealed insights into leaf movement and nitrogen fixation
光荚含羞草单倍型解析基因组揭示了叶片运动和固氮的相关机制 摘要
背景
光荚含羞草起源于热带美洲，具有独特的叶片运动特征，其运动速度…
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QIIME 2教程. 21进化树q2-phylogeny(2021.2)
使用q2-phylogeny进行系统发育推断 Phylogenetic inference with q2-phylogeny https://docs.qiime2.org/2021.2/tutorials/phylogeny/ 开始本节分析前，我们假定你已经完成了前面内容的学习。 在QIIME 2中可用的几个下游多样性指标要求使用正在研究的操作分类单位&a…
Anaconda的安装、配置与使用conda安装软件
利用conda快速安装软件
安装软件与使用软件是计算生物学需要掌握的技能，大部分的软件都是命令行软件。早先的时候安装软件特别麻烦，现在出了很多自动安装软件的框架，例如conda。起初这个框架只是为了方便安装Python 版本与Packagesÿ…
iMeta | 兰州大学张东青年研究员：使用PhyloSuite进行分子系统发育及系统发育树的统计分析...
点击蓝字 关注我们 使用PhyloSuite进行分子系统发育及系统发育树的统计分析 iMeta主页：http://www.imeta.science 方 法 ● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.87 ● 2023年2月16日，兰州大学张东团队在 iMeta 在线发表了题为“Using PhyloSuit…
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MAFFT多重序列比对--(附比对彩标方法)
[转记]MAFFT多重序列比对图解教程 【絮语】 一提到多重序列比对，很多人禁不住就想到ClustalW（Clustalx为ClustalW的GUI版），其实有一款多重序列比对软件－MAFFT，不论从比对速度（Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee），还是比对准确性（MAFFT>Muscle>T-Coffee&…
MAFFT多重序列比对图解教程
【絮语】 一提到多重序列比对，很多人禁不住就想到ClustalW（Clustalx为ClustalW的GUI版），其实有一款多重序列比对软件－MAFFT，不论从比对速度（Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffeeÿ…
构建系统发育树~序列对比 MEGA、MAFFT（图文教程）
前言
构建进化树的流程为：整合各个基因文件到一个fasta文件中→进行序列对比→建树。序列对比是构建进化树的基础，主要是为了确定所有序列的同源位点能相互对应。 一、MEGA进行序列对比 刚开始最先使用的序列对比软件是MEGA7.0，首先点击Alig…
使用mafft进行多序列比对
欢迎关注”生信修炼手册”! 对于几千条序列的多序列比对，无论是从准确度还是运行速度上考虑，muscle通常都是最佳选择。但是muscle 的内存优化做的并不好，如果所需内存超出了机器内存，此时可以考虑mafft 这个工具。官网如下 https:…
clustalw序列比对_生信学习笔记——Python+Mafft实现批量化多序列比对
Mafft介绍 一提到多重序列比对，很多人禁不住就想到ClustalW（Clustalx为ClustalW的GUI版），其实有一款多重序列比对软件－MAFFT，不论从比对速度（Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee），还是比对准确性（MAFFT>Muscle>T-Coffee>ClustalW）来说，其相比于Clus…
生信软件，就是赢家通吃：最佳生信比对软件
在生物信息学中，比对软件是解析和处理生物序列数据的核心工具。它们广泛应用于基因组学、转录组学以及蛋白质组学研究中。今天，我将带大家了解几款常用的比对软件，分析它们的功能特点、优缺点，以及它们在不同研究场景中的适用性。…
MAFFT安装及使用-mafft v7.520（bioinfomatics tools-004）
生物序列数据分析是生物信息学的核心任务，是了解生物大分子结构和功能、生物进化历程中联系和差异的主要途径。由于测序技术迅猛发展，产生了大量的核苷酸等生物序列数据，同时随着千人基因组和地球生物基因组计划的开展，越来越需要…
生信步骤｜MAFFT结合HMMER进行多序列比对和基于隐马模型的基因搜索
蛋白质都是由相似的小型结构域组成的。如果我们有若干个已知的蛋白序列，那我们就可以根据这些蛋白序列比较其含有的保守域，寻找在蛋白数据库中上是否也有一样保守域的蛋白。而后根据统计学模型，将显著性较高的蛋白序列预测为同一类基因家族蛋…
多序列比对算法MAFFT以及HMMER和profile文件的使用
最近需要将蛋白质建模与虚拟筛选结合起来使用，要做的笔记可能会有点杂，有些可以拿来参考的。
一、多序列比对算法MAFFT
最经典和广为熟知的多序列比对软件是 clustalw 。 但是现有的多序列比对软件较多，有文献报道：比对速度&…
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[蓝桥杯] 36进制 （Python 实现）
题目： 代码：
#36进制
#M22, A10, N23, Y34
res 22 * 36**3 10 * 36**2 23 * 36**1 34 * 36**0
print(res)结果：1040254
SQLi LABS Less-36 报错注入
「作者简介」：冬奥会网络安全中国代表队，CSDN Top100，就职奇安信多年，以实战工作为基础著作 《网络安全自学教程》，适合基础薄弱的同学系统化的学习网络安全，用最短的时间掌握最核心的技术。 第三十六关注入…
mysql-5.7.36压缩包安装图文教程
1. 卸载
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管理员身份运行 cmd，使用命令 net stop mysql，停止服务。 1.2 卸载服务
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打印36进制的条码序列号
打印36进制的条码序列号 客户需求操作步骤客户需求
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